Mission :
Il/Elle réalisera des prestations et des projets de recherche en protéomique (préparation d'échantillons, acquisitions MS,
analyses). Il/Elle développera et appliquera des méthodes en protéomique sur cellules uniques, en protéomique spatiale
et pour l'analyse des protéines membranaires.
Activités :
- Concevoir et conduire des développements technologiques innovants en relation avec les projets des utilisateurs ou
partenaires et des équipes du CRCM
- Réaliser la préparation des échantillons protéiques, appliquer et adapter les techniques de biochimie
- Mettre en œuvre les techniques de spectrométrie de masse couplée à la chromatographie liquide à haute performance
- Analyser des données LC-MS/MS
- Rédiger et communiquer des rapports et des notes techniques
- Conseiller les utilisateurs et les partenaires de la plateforme et les accompagner en amont et en aval de l'analyse
protéomique
- Participer aux opérations de maintenance des équipements
- S'impliquer dans la démarche qualité
Compétences :
Connaissances
Biologie, biochimie et chimie des protéines (connaissances approfondies)
Spectrométrie de masse et nanochromatographie liquide (connaissances approfondies)
Environnement et réseaux professionnels en protéomique

Traitement informatique et enrichissement par bioinformatique des données de protéomique (connaissances
approfondies)
Langue anglaise: B2 à C1 selon le cadre européen de langues
Savoir-faire
Coordonner différents projets
Assurer une expertise en protéomique
Piloter et maintenir des spectromètres de masse
Utiliser des logiciels spécifiques à la protéomique
Savoirs-être
Rigueur / Fiabilité
Capacité à travailler en équipe
Dynamisme
Autonomie
Aptitude à transmettre
Contraintes particulières
Variabilité éventuelle des horaires de travail selon les besoins du service
Suivre le fonctionnement des spectromètres de masse à distance
Contexte :
L' ingénieur.e de recherche partagera son activité à 50 % au sein de la plateforme multisite Marseille Protéomique, sous
la direction des ingénieurs responsables,
et à 50% au sein de l'équipe MemProt « Protéomique de la membrane et Cancer », au Centre de Recherche en
Cancérologie de Marseille (CRCM), sous la direction du responsable d'équipe.
Marseille Protéomique (MaP), labellisée IBiSA, met à disposition de la communauté scientifique ses compétences en
analyse protéomique pour accompagner les projets en sciences biologiques. Certifié ISO-9001/NF X50-900 pour la
qualité des plateformes technologiques en sciences de la vie, le site MaP-CRCM utilise la protéomique pour
comprendre les mécanismes moléculaires du cancer. Il développe des approches quantitatives appliquées aux
protéomes complexes, secrétomes, vésicules extracellulaires, interactomes, modifications post-traductionnelles et
chimioprotéomique, immunopeptidomique, avec 3 spectromètres Orbitrap dont 1 Astral.
L'équipe MemProt utilise la spectrométrie de masse pour analyser les protéines présentes à la surface des cellules
cancéreuses. Elle vise à identifier des isoformes et des modifications post-traductionnelles en lien avec la progression
des cancers, la résistance aux traitements et la récidive. Elle développe des approches en protéomique de cellules
uniques et en protéomique spatiale pour étudier l'hétérogénéité cellulaire dans des modèles tels que les xénogreffes, les
tumoroïdes et les biopsies de patients.
Cette équipe s'inscrit dans la politique stratégique du CRCM pour renforcer ses capacités en recherche. Depuis sa
création, la protéomique a gagné en maturité et en complexité, élargissant ses applications à des thématiques
interdisciplinaires.
Pour maintenir ce niveau d'expertise et répondre à une demande croissante, ce recrutement est essentiel afin d'assurer la
continuité des analyses sur la plateforme MaP et de soutenir l'innovation dans le réseau MaP et les centres de recherche
en région PACA.

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